O CESGA achega cálculo para acadar menos emisións de CO2 do gando vacún
luns, 15 de outubro do 2018
O
Centro de Supercomputación de Galicia está a abrir importantes
vertentes de traballo no ámbito green, máis polo miúdo na
biotecnoloxía relacionada cos sectores primarios. Un dos proxectos
medio ambientais máis destacados nos que coopera consiste en reducir
con cálculo de alto rendemento as emisións de CO2 emitidas polo
gando vacún, unha grave problema ambiental que acrecenta, xunto coa
actividade humana, o catastrófico quecemento global (hoxe en día un
12% da enerxía consumida polas vacas a través da súa alimentación
regresa á atmosfera con feitura de metano; e ademais, consumir un
quilo de carne de vaca equivale a realizar unha viaxe de 50
quilómetros en coche). O
CESGA está a contribuír a este proxecto coa capacidade e o tempo de
cálculo precisos.
O
proxecto vén da man do Instituto
Nacional de Investigación e Tecnoloxía Agraria e Alimentaria
(INIA) e insírese no seu obxectivo de mellorar a xenética do vacún
para diminuír as emisións e “contribuír a unha produción de
leite e de carne máis sustentábel”. Con este fin, analízase o
xenoma e o metaxenoma de 500 animais da Cornixa Cantábrica e do
Levante, poñendo o foco na raza Holstein (coñecida como frisona).
O proxecto comezou en 2017 e prevese que culmine en 2020. Ten dúas
frontes principais de actuación: por unha banda optimizar as fontes
de alimentación con materias primas que na dixestión deixen menos
hidróxeno libre, e pola outra, seleccionar daquelas familias que
durante o proceso dixestivo produzan menos metano no rume. Ou sexa,
búscanse animais que aproveiten mellor a enerxía que consumen.
O
equipo do INIA centrado no proxecto (integrado por unha ducia de
investigadores, persoal de laboratorio, técnicos e estudantes) está
traballando para obter o xenoma e o metaxenoma de medio milleiro de
vacas da Cornixa Cantábrica e Levante. Avaliar a fondo as
características do ADN posibilitará, nas súas palabras,
“identificar os animais da poboación cunha maior eficiencia
dixestiva”. O traballo ten unha fase de xenotipado do sangue e, a
partir de aí, ábrense unha chea de posicións de marcadores
xenéticos, dos que é posíbel adiviñar até 650.000 empregando
técnicas estatísticas. O labor despregado chega até os detalles
máis miúdos: leva aos investigadores ao coñecemento de rexións do
ADN que subministran pautas a apetencia dun animal, a predisposición
xenética a comer máis ou menos, etc.
Como
dixemos, o papel do Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA) no
proxecto consiste basicamente en achegar ao INIA as “altas
necesidades de memoria RAM e o tempo de cálculo” precisos para
conseguir os obxectivos marcados. Cómpre ter en conta que os
investigadores involucrados neste traballo empregan grandes bases de
datos xenómicos procedentes de xenotipado e secuenciado completos,
tanto dos animais como das súas microbiotas, información que logo
debe almacenarse, xunto con todos os arquivos e resultados
intermedios e finais do procesamento das secuencias. No 2017 usáronse
máis de 500 gigabytes pero a previsión é de que esta cifra medre
de maneira exponencial e se multiplique por cen.
O
ano pasado, os investigadores empregaron máis de 16.000 horas de
supercomputación.
A
investigación do INIA pretende solucionar unha das principais
preocupacións dos gandeiros, que contarán con máis información
xenética para as súas decisións na reprodución da especie,
ademais de contribuír ao uso de menos recursos na alimentación
vacúa e a unha produción máis sustentábel no conxunto do sector.